2008-2009 sezonu Fortis Türkiye Kupası Çeyrek Final kuraları Ataköy Olimpiyat Evi'nde gerçekleştirilen törenle çekildi.

Çift maçlı eliminasyon sistemine göre 28 Ocak ve 4 Şubat 2009 tarihlerinde oynanacak Fortis Türkiye Kupası Çeyrek Final maçlarının eşleşmeleri şu şekilde gerçekleşti:

Fenerbahçe	-	Bursapor
Galatasaray	-	Sivasspor
Antalyaspor	-	Beşiktaş
Denizlispor	-	Ankaraspor

Not: Türkiye Futbol Federasyonu gerekli gördüğü takdirde maç tarihleri değiştirebilecek.

Fortis Türkiye Kupası Çeyrek Final Kuraları Çekildi