Eskişehirspor, UEFA Avrupa Ligi'ndeki St. Johnstone maçı ile tam 37 yıl aradan sonra UEFA kupalarında mücadele edecek. Avrupa Kupalarında toplamda 14 maç oynayan Eskişehirspor bu karşılaşmalardan 3'ünü kazanırken, 2 beraberlik, 9 yenilgi aldı. Rakip fileleri 13 kez havalandıran kırmızı şimşekler kalesinde 26  gol gördü.

Avrupa arenasına ilk kez 1970-71 sezonunda daha sonradan adı UEFA Kupası olan Fuar Şehirleri Kupası'na katılarak çıkan Eskişehirspor, ilk turda güçlü İspanyol temsilcisi Sevilla'yı  0-1 ve 3-1'lik skorlar sonucunda eleyerek büyük bir başarıya imza attı. 1-0 mağlup oynadıkları maçın son 10 dakikasına 3 gol sığdırarak 3-1'lik galibiyete ulaşan Es Es'in gollerinin üçünde de TFF Yönetim Kurulu üyesi Fethi Heper'in imzası vardır. Kırmızı-siyahlılar ikinci turda Eskişehir'de 3-2 mağlup ettiği Hollanda temsilcisi Twente'ye deplasmanda 6-1'lik skorla boyun eğince elenmekten kurtulamadı.

Eskişehirspor 1971-72 sezonunda ise ülkemizi Kupa Galipleri Kupası'nda temsil etti. İlk turda deplasmanda golsüz berabere kaldığı Finlandiya'nın Mikkeli takımını sahasında 4-0 yenerek tur atlayan kırmızı-siyahlılar, ikinci turda o dönemki ismiyle SSCB'nin Dinamo Moskova takımına iki maçı da 1-0 kaybederek elendi.

Aynı kupada 1972-73 sezonunda İtalya'nın Fiorentina takımına 2-1 ve 3-0 yenilerek elenen Eskişehirspor, ertesi sezon ise evinde 0-0 berabere kaldığı Almanya'nın Köln takımına deplasmanda 2-0 mağlup olunca Avrupa macerasını noktaladı. 1975-76 sezonunda Bulgar Levski Sofya ile eşleşen kırmızı-siyahlılar rakibine 3-0 ve 4-1'lik skorlarla boyun eğerek elendi.

Son Avrupa macerası Balkan Kupası'nda

1970 ve 1975 yılları ile 1987-88 sezonunda Balkan Kupası'nda mücadele eden temsilcimiz, 1975'te Bulgaristan'ın Lokomotif Sofya ve ardından Romanya'nın Farul Constanta takımlarını eleyerek finale yükseldi. Kırmızı-siyahlılar finalde Yugoslav ekibi Radnicki Niş'e 1-0 ve 2-1 yenilmekten kurtulamadı. Eskişehirspor, Avrupa arenasındaki son maçını 1987-1988 sezonunda Romanya'nın F.C Cornivul Hunedoara takımına karşı oynadı.