TFF 3. Lig'de 2007-2008 sezonu tamamlanırken, gruplarda şampiyon olan ve küme düşen takımlar belli oldu.
1. Grup'ta Belediye Vanspor, Malatya Belediyespor ve Karsspor, 2. Grup'ta Tokatspor, Ofspor ve Çorumspor, 3. Grup'ta Denizli Belediyespor, Akhisar Belediye Gençlikspor ve Konya Şekerspor, 4. Grup'ta da Beykoz 1908, Beylerbeyi ve Körfez Belediyespor ilk 3 sırada yer alarak TFF 2. Lig'e yükseldi.
1. Grup'ta Bingöl Belediyespor ve Şırnakspor 2. Grup'ta Kastamonuspor, Keçiörengücü, 3. Grup'ta Altınordu, Balıkesirspor 4. Grup'ta Yıldırım Bosnaspor ve Darıca Gençlerbirliği takımları 4 ve 5 oldular ve TFF 2. Lig'e çıkmak için play-off maçları oynamaya hak kazandı. Play-Off maçları sonunda Altınordu ve Darıca Gençlerbirliği TFF 2. Lig'e yükseldi.
1. Grup'ta Antakyaspor, Cizrespor, Mezitlispor, Nusaybin Demirspor 2. Grup'ta Bağlum Belediyespor, Gazi Belediyespor ve Artvin Hopaspor, 3. Grup'ta Kütahyaspor, Muğlaspor, Yeni Ereğlispor ve Yeni Burdurspor, 4. Grup'ta Zonguldakspor, Bursa Merinosspor, Küçükçekmecespor ve Bilecikspor bir alt kümeye düştüler.
Öte yandan, 1. Grup'ta play-off oynayacak ikinci takım ile bir alt lige düşecek dördüncü takım yarıda kalan Nusaybin Demirspor ile Şırnakspor müsabakası hakkında federasyonca verilecek karardan sonra belli oldu.
Türkiye Futbol Federasyonu Yönetim Kurulu, Şırnakspor maçında yaşanan olaylar nedeniyle Nusaybin Demirspor'un 3-0 hükmen mağlubiyetine ve ayrıca 3 puanının tenziline karar verdi. Bu nedenle Nusaybin Demirspor 1. Grup'ta küme düşen 4. takım oldu.
Bu arada, 2. Grup'ta sezon içinde kulübe yapılan silahlı saldırı sonrasında maçlara çıkamayan ve hükmen yenik sayılan Bafra Belediyespor'un federasyon yönetim kurulunca daha önce ligde kalması kararlaştırılmıştı.
Gruplarda oynanan son hafta karşılaşmalarında alınan sonuçlar ve oluşan puan durumları şöyle:
TFF 3. Lig - Grup 01 - 30 . Hafta
TFF 3. Lig - Grup 02 - 30 . Hafta
TFF 3. Lig - Grup 03 - 34 . Hafta
TFF 3. Lig - Grup 04 - 30 . Hafta