2012-2013 Futbol Sezonu Spor Toto 3. Lig'de grup maçlarının tamamlanmasının ardından Play-off'a kalan takımların kura çekimi gerçekleştirildi.

Türkiye Futbol Federasyonu'nun İstinye'deki binasında yapılan kura çekimine, Genel Sekreter Vekili Özcan Şepik ve kulüplerin temsilcileri katıldı. Kura çekimi öncesi, vefat eden Bursaspor Başkanı İbrahim Yazıcı için saygı duruşunda bulunuldu.

Play-off'a kalan takımları tebrik eden Şepik, kura çekimi sonrası oynanacak maçlarda tüm takımlara başarılar diledi.

Yapılan kura çekimi sonrası Play-off eşleşmeleri şöyle oluştu: 

SPOR TOTO 3. LİG 1. GRUP
15 MAYIS ÇARŞAMBA
İSTANBULSPOR A.Ş.	TEKİROVA BELEDİYESPOR	MALATYA İNÖNÜ	16:00
16 MAYIS PERŞEMBE
PAZARSPOR	FATİH KARAGÜMRÜKSPOR A.Ş.	MALATYA İNÖNÜ	16:00
19 MAYIS PAZAR
1. MAÇ GALİBİ	2. MAÇ GALİBİ	MALATYA İNÖNÜ	16:00
SPOR TOTO 3. LİG 2. GRUP
14 MAYIS SALI
SİVAS 4 EYLÜL BLD. SPOR	DARDANELSPOR A.Ş.	ALANYA OBA	17:00
15 MAYIS ÇARŞAMBA
ÜMRANİYESPOR	BATMAN PETROLSPOR	ALANYA OBA	17:00
18 MAYIS CUMARTESİ
1. MAÇ GALİBİ	2. MAÇ GALİBİ	ALANYA OBA	16:00
SPOR TOTO 3. LİG 3. GRUP
13 MAYIS PAZARTESİ
KEÇİÖRENGÜCÜ	GÜMÜŞHANESPOR	YOZGAT ŞEHİR	16:00
14 MAYIS SALI
KAHRAMANMARAŞ BLD.	DARICA GENÇLERBİRLİĞİ	YOZGAT ŞEHİR	16:00
17 MAYIS CUMA
1. MAÇ GALİBİ	2. MAÇ GALİBİ	YOZGAT ŞEHİR	16:00