Spor Toto 3. Lig'de 2010-2011 sezonu hafta sonu oynanacak karşılaşmalarla başlayacak. Bu sezon 18'er takımdan oluşan 3 ayrı grupta düzenlenen ligde ilk yarı 26 Aralık 2010'da oynanacak 17. hafta karşılaşmaları ile bitecek. İkinci devresi 23 Ocak 2011'de başlayacak Spor Toto 3. Lig'de normal sezon 15 Mayıs 2011'de oynanacak maçlarla sona erecek. İlk defa bu sezon Spor Toto'nun isim sponsorluğu altında oynanacak 3.Lig'de her grubun birincisi olan 3 takım doğrudan Spor Toto 2. Lig'e yükselecek.

Her grubu 2., 3.,4. ve 5. takımlar Play-Off oynama hakkını kazanacak. Play-Off'larda, grubunu ikinci sırada bitiren takımlar ile aynı grubu beşinci sırada bitiren takımlar; üçüncü sırada bitiren takımlar ile aynı grubu dördüncü sırada bitiren takımlarla eşleşecek ve tek maç eleme usulüne göre müsabaka yapacak. Bu müsabakalarda kazanan takımlar final oynayacak ve finalde kazanan takımlar ise Spor Toto 2. Ligi'ne yükselecek. Böylece toplam 6 takım Spor Toto 2. Lig'e yükselmiş olacak.

Spor Toto 3. Lig'de gruplarda 16, 17 ve 18. sıraları alan toplam 9 takım Bölgesel Amatör Lig'e düşecek.