TFF 3. Lig Yükselme ve klasman grupları'nda 2008-2009 sezonu 23-24 Mayıs'ta oynanan karşılaşmalar ile tamamlandı. Yükselme Grubu'nu ilk 4 sırada tamamlayan, Göztepe A.Ş., Tepecik Belediyespor, Tavşanlı Bld. TKİ Linyitspor ve Kahramanmaraşspor önümüzdeki sezon TFF 2.Lig'de mücadele edecek.

Yükselme Grubu'nu 5, 6 ve 7. sırada tamamlayan  Ankara Demirspor, Hatayspor, Pursaklar A.Ş. ile Klasman Grupları'nı 1. sırada tamamlayan, Yalovaspor, Balıkesirspor, İnegölspor, Kastamonuspor, Batman Belediyespor, elemeler de mücadele edecek. TFF tarafından belirlenecek ve tarafsız saha ve sahalarda tek maçlı eleme usulü ile oynanacak eleme grubu eşleşmeleri kura ile belirlenecek ve bu gruptan 2 takım daha TFF 2. Lig'e yükselecek.

Klasman gruplarında son 2 sırada tamamlayan 10 takım, Orhangazi Gençlerbirliği, F.Karagümrük, Aydınspor, M.Kemalpaşaspor, Aksarayspor, Uşakspor, Erzincanspor, D.Ç.Divriğispor, Bağlar Vuralspor, Kilis Belediyespor illerindeki mahalli amatör lige düştüler.

TFF 3. Lig'in son haftasında alınan sonuçlar ve oluşan puan durumları şöyle;